More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3187 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  785    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  81.3 
 
 		 402 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  86.48 
 
 		 402 aa  674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  81.3 
 
 		 402 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  68.07 
 
 		 403 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  63.5 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  62.69 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  61.75 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  60.1 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  60.1 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  52.14 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  60.7 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  54.36 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  54.86 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  49.88 
 
 		 403 aa  401  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  56.5 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  53.23 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  51.24 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  53.23 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  42.47 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  44.36 
 
 		 402 aa  312  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.1 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  44.08 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  39.31 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  42.12 
 
 		 409 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  45.1 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  45.1 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  44.85 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  43.96 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  42.61 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  42.36 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.34 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 		 658 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  42.12 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  40.05 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  38.42 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  43 
 
 		 671 aa  272  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  40.36 
 
 		 707 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  39.55 
 
 		 409 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.27 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  41.18 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  41.07 
 
 		 406 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  36.73 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  42.57 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.63 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.9 
 
 		 715 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.29 
 
 		 661 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.6 
 
 		 656 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40 
 
 		 644 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  37.28 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  41 
 
 		 657 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  39.55 
 
 		 657 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.85 
 
 		 653 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.95 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.89 
 
 		 651 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  41.91 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  40.54 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  38.2 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  40.45 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.37 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  36.36 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.14 
 
 		 653 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  39.8 
 
 		 670 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  40.75 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  39.66 
 
 		 410 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.51 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.65 
 
 		 657 aa  245  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  41.35 
 
 		 650 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  39.51 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  37.91 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  37.47 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  39.66 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  37.12 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  37.41 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  39.35 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.64 
 
 		 652 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  39.35 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  37.41 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.46 
 
 		 409 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  35.66 
 
 		 647 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  38.24 
 
 		 410 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  37.65 
 
 		 410 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.01 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  38.54 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  38.54 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  35.77 
 
 		 652 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  36.75 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.66 
 
 		 653 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  35.95 
 
 		 653 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  36.38 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  36.64 
 
 		 392 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  35.4 
 
 		 654 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  35.04 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  37.91 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>