More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6962 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  82.48 
 
 		 411 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  787    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  45.63 
 
 		 406 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  42.5 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  44.29 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  43.55 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  43.96 
 
 		 407 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  41.81 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  38.59 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.11 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  43.49 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43.49 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.42 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  41.82 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  42.72 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  41.93 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  41.93 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  39.17 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  39.66 
 
 		 405 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.79 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  37.62 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.12 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  41.99 
 
 		 409 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.53 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.91 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  41.36 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  40.63 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  38.98 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  40 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  40.49 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  39.71 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  40.39 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  39.15 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  39.32 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  38.54 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  38.54 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  39.9 
 
 		 409 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  40.53 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  39.32 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  42.57 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 658 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  36.98 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  41.35 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  39.76 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  39.9 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  40.33 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  38.3 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  40.68 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  40.2 
 
 		 643 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  41.26 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  35.22 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.26 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.69 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  41.26 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  39.07 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  39.07 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  38.6 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  39.66 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  39.66 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.75 
 
 		 412 aa  242  9e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  39.01 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  37.83 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  39.07 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  36.93 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  39.11 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  39.17 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  42.32 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  37.71 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.36 
 
 		 707 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  38.33 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  38.37 
 
 		 647 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.14 
 
 		 644 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  36.18 
 
 		 653 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  35.45 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  39.02 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  39.5 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  36.83 
 
 		 657 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.75 
 
 		 651 aa  225  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  33.57 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  33.86 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.59 
 
 		 653 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  40.44 
 
 		 653 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  35.94 
 
 		 663 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.75 
 
 		 670 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.65 
 
 		 661 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  35.45 
 
 		 663 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  36.52 
 
 		 671 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  37.65 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.47 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  36.41 
 
 		 657 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 654 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 		 645 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>