More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0294 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  100 
 
 		 409 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  100 
 
 		 409 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  75.79 
 
 		 409 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  74.57 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  76.04 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  71.95 
 
 		 410 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  71.71 
 
 		 410 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  72.61 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  71.39 
 
 		 409 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  70.66 
 
 		 409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  60.2 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  54.21 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  55.75 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  55.75 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  51.5 
 
 		 405 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  51.75 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  53.25 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  45.96 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  45.96 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  48.02 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  42.51 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  39.9 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  39.52 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  40.87 
 
 		 414 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  37.81 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  38.15 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  39.4 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40.29 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  39.71 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  39.4 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.46 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  38.5 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  37.59 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  38.39 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  38.39 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  38.33 
 
 		 671 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  38.14 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  38.27 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.61 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  37.13 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  36.55 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.7 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  39.5 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  39.39 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  39 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  37.19 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  38.25 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  39.29 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.81 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.81 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  36.34 
 
 		 406 aa  246  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  38.97 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.48 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  36.91 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  37.97 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  40.25 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.29 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  38.77 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  38.25 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  39.07 
 
 		 410 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.07 
 
 		 644 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  38.85 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.68 
 
 		 661 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  35.73 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  38.2 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  37.66 
 
 		 647 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  37.25 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  34.01 
 
 		 658 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  39 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  36.79 
 
 		 656 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.52 
 
 		 656 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.72 
 
 		 667 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  32.81 
 
 		 715 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  36.66 
 
 		 652 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  37.8 
 
 		 412 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  37.28 
 
 		 657 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.77 
 
 		 653 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  37.81 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  36.48 
 
 		 682 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.48 
 
 		 667 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  36.48 
 
 		 682 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  36.79 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  39.4 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  37.69 
 
 		 648 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.1 
 
 		 653 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  35.26 
 
 		 656 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  36.95 
 
 		 696 aa  226  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.68 
 
 		 707 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>