More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1082 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  908    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  65.46 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  63.88 
 
 		 401 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  56.66 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  59.28 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  55.08 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  54.28 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  54.28 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  54.05 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  52.3 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  51.69 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  51.73 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  49.21 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  49.55 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  50.45 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  49.77 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  50.45 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  50 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  38.03 
 
 		 406 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  40.85 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  42.98 
 
 		 409 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  42.76 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  42.76 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  40.18 
 
 		 409 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  40.18 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  39.95 
 
 		 409 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  35.59 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 406 aa  292  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  39.29 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.06 
 
 		 405 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  40.82 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  38.57 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 		 404 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 		 406 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.99 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  34.56 
 
 		 715 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  36.06 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  35.52 
 
 		 412 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  41.2 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 658 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  39.86 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.64 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  40.23 
 
 		 657 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  36.87 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.94 
 
 		 707 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  37.95 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  36.26 
 
 		 406 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  40.41 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  39.04 
 
 		 657 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  37.44 
 
 		 657 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  38.21 
 
 		 670 aa  244  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  36.38 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  36.85 
 
 		 403 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.3 
 
 		 653 aa  237  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.56 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  35.89 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.05 
 
 		 661 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  35.01 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.45 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  34.9 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  34.76 
 
 		 657 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.94 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  35.92 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  34.76 
 
 		 647 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  33.77 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  33.77 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.77 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.45 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.88 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.45 
 
 		 653 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  35.7 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 654 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  34.29 
 
 		 644 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  33.9 
 
 		 414 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  35.13 
 
 		 652 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  32.59 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  34.54 
 
 		 656 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  34.76 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.5 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  35.28 
 
 		 654 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.24 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  33.41 
 
 		 649 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  35.86 
 
 		 671 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.24 
 
 		 410 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  33.86 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  34.59 
 
 		 681 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  34.59 
 
 		 681 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.21 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  33.69 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.69 
 
 		 651 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.56 
 
 		 663 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.29 
 
 		 653 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>