More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1168 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  809    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  58.87 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  54.04 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  53.38 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  52.53 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  52.02 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  52.38 
 
 		 409 aa  358  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  49.75 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  45.59 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  47.47 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  47.29 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  42.04 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  44.64 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  44.9 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  46.56 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  42.07 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 658 aa  322  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  45.15 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  43.62 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  45.8 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  45.55 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  47.1 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  46 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  46.85 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  46.6 
 
 		 409 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.06 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  44.22 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  42.93 
 
 		 657 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  43 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  41.77 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  39.74 
 
 		 715 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  42.43 
 
 		 656 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  41.07 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  41.52 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  41.52 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  43.75 
 
 		 670 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  38.97 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  46.68 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  43.69 
 
 		 651 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  43.6 
 
 		 657 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  43.24 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  42.11 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  43.49 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  42.68 
 
 		 653 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  42.26 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  41.94 
 
 		 657 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  43.7 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  39.86 
 
 		 456 aa  282  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.25 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.96 
 
 		 644 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  39.56 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  41.41 
 
 		 657 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  40.94 
 
 		 405 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  43.93 
 
 		 409 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.43 
 
 		 652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  44.3 
 
 		 671 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  43.33 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  39.56 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  41.13 
 
 		 412 aa  272  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  42.57 
 
 		 661 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  40.75 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.7 
 
 		 663 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.95 
 
 		 663 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.94 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  40.51 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  39.55 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  39.55 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.48 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  42.32 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 654 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  39.9 
 
 		 656 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  41.41 
 
 		 405 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  42 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 		 678 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  42.86 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  42.32 
 
 		 653 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  40.25 
 
 		 678 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  40.25 
 
 		 678 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  39.39 
 
 		 657 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  40.05 
 
 		 647 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  42.11 
 
 		 654 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  40.25 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  40.91 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  40.91 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  40.35 
 
 		 654 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.1 
 
 		 650 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  41.27 
 
 		 656 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.52 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  41.79 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  38.97 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  38.9 
 
 		 687 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  39.15 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  39.15 
 
 		 681 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  39.04 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  39.15 
 
 		 681 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>