More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1437 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  80.68 
 
 
409 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  100 
 
 
409 aa  793    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  72.13 
 
 
409 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  67.73 
 
 
409 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  70.66 
 
 
409 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  70.66 
 
 
409 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  62.68 
 
 
410 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  63.57 
 
 
398 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  62.68 
 
 
410 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  63.08 
 
 
409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  61.6 
 
 
407 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  55.69 
 
 
405 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  55.69 
 
 
405 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  53.47 
 
 
405 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  54.95 
 
 
405 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  53.47 
 
 
405 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  48.27 
 
 
405 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  48.02 
 
 
405 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  49.01 
 
 
403 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  44.72 
 
 
443 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  40.53 
 
 
423 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.59 
 
 
405 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  42.75 
 
 
409 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  42.51 
 
 
409 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  41.36 
 
 
415 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  41.83 
 
 
394 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  40.19 
 
 
414 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  39.27 
 
 
406 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  38.86 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.27 
 
 
405 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  41.85 
 
 
409 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  42.07 
 
 
414 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  41.9 
 
 
405 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 
406 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
406 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  39.25 
 
 
647 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.62 
 
 
715 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.99 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  40.65 
 
 
404 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  38.27 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.56 
 
 
400 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  41.6 
 
 
402 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  40.3 
 
 
402 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  39.26 
 
 
400 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  40.3 
 
 
402 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  38.46 
 
 
401 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  36.72 
 
 
394 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  41.23 
 
 
431 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  42.05 
 
 
420 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  38.46 
 
 
402 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  42.05 
 
 
420 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  41.04 
 
 
671 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  40.4 
 
 
400 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 
409 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  42.05 
 
 
420 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  39.11 
 
 
409 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  35.57 
 
 
406 aa  246  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  38.06 
 
 
401 aa  246  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40.44 
 
 
411 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.8 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  38.59 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  41.87 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  39.9 
 
 
410 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.42 
 
 
408 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  40.89 
 
 
398 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  40.2 
 
 
653 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.65 
 
 
661 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.62 
 
 
644 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  37.62 
 
 
409 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  41.03 
 
 
401 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.52 
 
 
656 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.93 
 
 
651 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  38.27 
 
 
656 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.46 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  37.28 
 
 
667 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.48 
 
 
403 aa  235  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
401 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  40.29 
 
 
401 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  37.78 
 
 
682 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  37.28 
 
 
667 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  37.78 
 
 
682 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 
658 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38 
 
 
657 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  34.99 
 
 
394 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
397 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  37.92 
 
 
412 aa  232  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  35.26 
 
 
656 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  36.68 
 
 
653 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  38.61 
 
 
409 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  35.98 
 
 
678 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.98 
 
 
678 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.25 
 
 
670 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  35.98 
 
 
678 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
410 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
654 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>