More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10590 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  100 
 
 
385 aa  759    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  53.11 
 
 
387 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  39.33 
 
 
391 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  38.27 
 
 
406 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  34.45 
 
 
405 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  34.86 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.25 
 
 
409 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  35 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.28 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  34.16 
 
 
401 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 
401 aa  215  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  34.31 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  36.01 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 
406 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  34.11 
 
 
401 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  34.5 
 
 
653 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 
408 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
406 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 
405 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 
392 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  34.38 
 
 
410 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  33.91 
 
 
409 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  35.82 
 
 
405 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  35.82 
 
 
405 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
410 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.43 
 
 
405 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  35.35 
 
 
663 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  34.99 
 
 
400 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.85 
 
 
663 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.67 
 
 
657 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  34.62 
 
 
410 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
405 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.51 
 
 
409 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  34.56 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  34.9 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  32.41 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  34.9 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.25 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  34.02 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  34.73 
 
 
403 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  35.08 
 
 
656 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  33.89 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.36 
 
 
410 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  34.48 
 
 
409 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  34 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  34.1 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  33.67 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  32.17 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  33.5 
 
 
657 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  32.92 
 
 
668 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  32.92 
 
 
668 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  33.25 
 
 
656 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.27 
 
 
658 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  33.66 
 
 
406 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.51 
 
 
405 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  32.92 
 
 
410 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  34.1 
 
 
643 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  34.31 
 
 
409 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  32.35 
 
 
400 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 
409 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.2 
 
 
403 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 
409 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.81 
 
 
414 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 
409 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.62 
 
 
661 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  35.29 
 
 
409 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
415 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
406 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  33.08 
 
 
657 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  33.68 
 
 
409 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  35.31 
 
 
397 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
405 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 
654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.18 
 
 
409 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.64 
 
 
413 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  29.86 
 
 
456 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  35.47 
 
 
409 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  32.67 
 
 
657 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  33.75 
 
 
670 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
406 aa  189  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.91 
 
 
648 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  33.66 
 
 
653 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 
418 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  32.49 
 
 
654 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  34.03 
 
 
671 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.15 
 
 
644 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.02 
 
 
404 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  31.98 
 
 
402 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
410 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 
420 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  35.19 
 
 
408 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 
420 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.09 
 
 
653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.79 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>