More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4095 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  783    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  45.62 
 
 
397 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  46.15 
 
 
397 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  36.87 
 
 
404 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  37.19 
 
 
412 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  37.23 
 
 
423 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  34.79 
 
 
397 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0746  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  32.48 
 
 
397 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3982  protein of unknown function DUF214  37 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  32.74 
 
 
397 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  31.05 
 
 
404 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  31.05 
 
 
404 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0893  hypothetical protein  35.77 
 
 
389 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 
658 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  35.77 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
406 aa  166  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.34 
 
 
406 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.89 
 
 
400 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
409 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.04 
 
 
412 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
409 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.52 
 
 
407 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  36.52 
 
 
409 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
405 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.92 
 
 
657 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  31.17 
 
 
401 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  34.07 
 
 
644 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  35.51 
 
 
643 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.75 
 
 
656 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 
413 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.95 
 
 
653 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.94 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
406 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.54 
 
 
402 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 
402 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
404 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.78 
 
 
402 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.05 
 
 
657 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.73 
 
 
657 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.94 
 
 
399 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
405 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.93 
 
 
403 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  33.16 
 
 
656 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 
398 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.38 
 
 
394 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.48 
 
 
417 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.58 
 
 
417 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.92 
 
 
400 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  32.5 
 
 
657 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.72 
 
 
411 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  33 
 
 
417 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  34.05 
 
 
411 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.91 
 
 
663 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.62 
 
 
408 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.17 
 
 
409 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  34.37 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  32.99 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.54 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.15 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  30.92 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 
412 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  31.24 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.93 
 
 
443 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2472  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
393 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  31.42 
 
 
397 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.33 
 
 
410 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.41 
 
 
403 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
406 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  32.48 
 
 
401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.08 
 
 
663 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
405 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  32.48 
 
 
401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  34.12 
 
 
414 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.75 
 
 
402 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.21 
 
 
654 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 
405 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.52 
 
 
651 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.44 
 
 
661 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
406 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  30.97 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.66 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  32.45 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  34.1 
 
 
656 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  33.01 
 
 
654 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  30.97 
 
 
657 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  30.68 
 
 
437 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.02 
 
 
402 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  32.29 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.43 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
400 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
415 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>