More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  100 
 
 		 392 aa  738    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  52.54 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  46.13 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  46.15 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0308  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  45.88 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  46.67 
 
 		 425 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  43.08 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  44.27 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 422 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.85 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.97 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  26.15 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.83 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  31.74 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.54 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.56 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.07 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.83 
 
 		 651 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.83 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  32.46 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  32.86 
 
 		 411 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.9 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.44 
 
 		 641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.85 
 
 		 641 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 406 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.57 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.47 
 
 		 410 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.85 
 
 		 641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.08 
 
 		 643 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.52 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  30.87 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.68 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  30.38 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.45 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.47 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  29.57 
 
 		 666 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.89 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.24 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  30 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.43 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  27.05 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  27.27 
 
 		 647 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.98 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  27.79 
 
 		 656 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.2 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.26 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.6 
 
 		 661 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.03 
 
 		 641 aa  107  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.58 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  25.83 
 
 		 715 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.27 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  25.91 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.63 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  29.08 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  25.65 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.06 
 
 		 652 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  28.13 
 
 		 667 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.45 
 
 		 656 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.97 
 
 		 649 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.67 
 
 		 653 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  28.65 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  27.9 
 
 		 667 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  29.9 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.19 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  27.9 
 
 		 682 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  27.9 
 
 		 682 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>