More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4027 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
404 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  58.19 
 
 
412 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3982  protein of unknown function DUF214  54.05 
 
 
406 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  47.46 
 
 
397 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0893  hypothetical protein  48.62 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  47.46 
 
 
397 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  36.87 
 
 
406 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  36.75 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2472  protein of unknown function DUF214  37.34 
 
 
393 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.46 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0746  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 
407 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.5 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
405 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 
406 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.68 
 
 
394 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  33 
 
 
412 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  28.81 
 
 
409 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.65 
 
 
644 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  31.66 
 
 
643 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
409 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.81 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  28.43 
 
 
405 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.49 
 
 
398 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  29.86 
 
 
419 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  29.93 
 
 
418 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 
405 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  28.29 
 
 
409 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
405 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.18 
 
 
657 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
405 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.44 
 
 
410 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.92 
 
 
402 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
405 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  30.28 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.97 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.76 
 
 
443 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
392 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.27 
 
 
661 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
654 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
409 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  31.17 
 
 
417 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.18 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.88 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  31.3 
 
 
648 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.09 
 
 
417 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.18 
 
 
404 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
406 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
452 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  29.66 
 
 
656 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.37 
 
 
405 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  34.9 
 
 
394 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  30 
 
 
654 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.57 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.34 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.53 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.02 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.87 
 
 
663 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  31.39 
 
 
408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  28.57 
 
 
647 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.43 
 
 
653 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
406 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.9 
 
 
409 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.76 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.65 
 
 
645 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.39 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.46 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  30.34 
 
 
663 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.94 
 
 
651 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.92 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.94 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.89 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.61 
 
 
656 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  28.86 
 
 
668 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  28.86 
 
 
668 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.69 
 
 
649 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.14 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  30.71 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  30.13 
 
 
666 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  29.41 
 
 
657 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  29.9 
 
 
671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  28.68 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  27.93 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>