More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4309 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  98.81 
 
 
420 aa  811    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  97.38 
 
 
420 aa  803    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  78.33 
 
 
420 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
420 aa  819    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  38.01 
 
 
412 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  37.23 
 
 
417 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 
421 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.12 
 
 
411 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  37.41 
 
 
405 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  41.18 
 
 
410 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  40.93 
 
 
416 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  37.14 
 
 
404 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  42.05 
 
 
409 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  37.92 
 
 
407 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  36.41 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  37.65 
 
 
415 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  36.17 
 
 
410 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  36.3 
 
 
398 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  40.1 
 
 
407 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.17 
 
 
409 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  41.42 
 
 
415 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  35.1 
 
 
421 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.2 
 
 
409 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.61 
 
 
409 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  34.13 
 
 
421 aa  239  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  36.32 
 
 
405 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.19 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  39.76 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  36.45 
 
 
413 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  37.96 
 
 
409 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  37.96 
 
 
409 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  35.68 
 
 
409 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  40.24 
 
 
394 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.89 
 
 
410 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.25 
 
 
437 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 
405 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.7 
 
 
391 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  33.09 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 
412 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 
413 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  35.85 
 
 
406 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  35.58 
 
 
405 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 
417 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.43 
 
 
420 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  37.47 
 
 
413 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  36.62 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  39.28 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  39.28 
 
 
409 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  39.04 
 
 
409 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  35.59 
 
 
403 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.38 
 
 
406 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  35.43 
 
 
418 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  34.22 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  34.06 
 
 
411 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
405 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  36.9 
 
 
400 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  37.71 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.82 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  37.59 
 
 
402 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  36.46 
 
 
401 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  33.82 
 
 
393 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
413 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  38.59 
 
 
402 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  38.59 
 
 
402 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
410 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
414 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.88 
 
 
400 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  34.06 
 
 
408 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  34.35 
 
 
400 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  35.94 
 
 
405 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  35.94 
 
 
405 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.72 
 
 
412 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
392 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 
406 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
400 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
409 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
409 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
400 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
413 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  32.41 
 
 
456 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
406 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  35.61 
 
 
408 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  37 
 
 
415 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  34.22 
 
 
443 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  35.88 
 
 
402 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  35.12 
 
 
409 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  35.59 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  35.37 
 
 
402 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.83 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  35.35 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  36.65 
 
 
404 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  36.28 
 
 
409 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  37.41 
 
 
658 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>