More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0308 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0308  ABC transporter related protein  100 
 
 		 401 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  71.46 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  68.96 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  63.2 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  61.11 
 
 		 397 aa  411  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  57.72 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  58.44 
 
 		 403 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  55.39 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  53.28 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  47.8 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.28 
 
 		 495 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  35.61 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  33.92 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  32.75 
 
 		 655 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  29.2 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30.54 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  33.09 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 410 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.47 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.19 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.17 
 
 		 658 aa  130  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.63 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  32.34 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.43 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.43 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.64 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.28 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  30.71 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.2 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  31.39 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.94 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.35 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  29.04 
 
 		 707 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.18 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.15 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.74 
 
 		 653 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.85 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.15 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  30.18 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.43 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  26.63 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.61 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.1 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.7 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.03 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.61 
 
 		 409 aa  119  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  32.18 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  28.47 
 
 		 645 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  31.97 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.51 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  27.07 
 
 		 641 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.24 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.19 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  29.4 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.72 
 
 		 643 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  30.05 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.07 
 
 		 641 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  27.07 
 
 		 641 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.57 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  33.25 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  31.41 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.06 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.58 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  30.13 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  28.54 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  30.81 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.97 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.58 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  31.79 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  31.79 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  30.53 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.34 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.13 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>