More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8555 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  100 
 
 
391 aa  749    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  78.06 
 
 
392 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  73.4 
 
 
391 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  51.02 
 
 
407 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
415 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  50.76 
 
 
655 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  46.13 
 
 
495 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  48.62 
 
 
401 aa  288  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  47.62 
 
 
414 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  37.5 
 
 
425 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  35.32 
 
 
403 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  34.19 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  30.12 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.94 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.09 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.7 
 
 
415 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.04 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
409 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.28 
 
 
419 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 
424 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.29 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  30.88 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 
392 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
387 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.89 
 
 
407 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.78 
 
 
417 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.3 
 
 
385 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
401 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
421 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.35 
 
 
443 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
406 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.1 
 
 
410 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  30.27 
 
 
425 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 
402 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
405 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  26.98 
 
 
394 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  29.26 
 
 
438 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
404 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  27.27 
 
 
409 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.38 
 
 
417 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  27.27 
 
 
409 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  28.12 
 
 
415 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.21 
 
 
409 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.78 
 
 
643 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
410 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.77 
 
 
404 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 
413 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  26.15 
 
 
395 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  26.08 
 
 
409 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.29 
 
 
410 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  28.33 
 
 
397 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 
421 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 
405 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 
413 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.82 
 
 
410 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
400 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.77 
 
 
414 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.5 
 
 
391 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
417 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  27.79 
 
 
656 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
413 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
420 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
454 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  27.99 
 
 
687 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.6 
 
 
653 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.48 
 
 
409 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
413 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  30.88 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  30.49 
 
 
397 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  35.08 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.81 
 
 
421 aa  99.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
420 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
416 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  27.91 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.59 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.05 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  28.02 
 
 
681 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  28.02 
 
 
681 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 
380 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  28.64 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.58 
 
 
653 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  29.61 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.82 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  25.47 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.51 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  31.36 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  42.61 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.75 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  28.78 
 
 
417 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>