More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0028 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0028  ABC transporter related protein  100 
 
 		 628 aa  1212    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  32.35 
 
 		 655 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.1 
 
 		 657 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  48.2 
 
 		 656 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 246 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.33 
 
 		 256 aa  191  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.5 
 
 		 230 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 227 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.91 
 
 		 237 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  48.68 
 
 		 231 aa  185  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  49.1 
 
 		 657 aa  183  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 260 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  40.26 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.8 
 
 		 663 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  44.98 
 
 		 235 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.7 
 
 		 646 aa  181  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.02 
 
 		 648 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.66 
 
 		 253 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 648 aa  180  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.9 
 
 		 652 aa  180  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.72 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 253 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  47.95 
 
 		 247 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.49 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.98 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 248 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  44.93 
 
 		 249 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.7 
 
 		 248 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  49.33 
 
 		 252 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  46.4 
 
 		 657 aa  177  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.15 
 
 		 277 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 227 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 239 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 237 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.64 
 
 		 230 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 227 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 253 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 253 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 258 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.22 
 
 		 653 aa  174  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.59 
 
 		 645 aa  174  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 254 aa  174  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 228 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.6 
 
 		 226 aa  173  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 		 230 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.22 
 
 		 649 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  44.8 
 
 		 223 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  43.57 
 
 		 241 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 221 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  45.64 
 
 		 280 aa  173  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.45 
 
 		 228 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 253 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  41.7 
 
 		 641 aa  173  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.1 
 
 		 236 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 232 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.39 
 
 		 229 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  41.74 
 
 		 238 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  48.66 
 
 		 670 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.69 
 
 		 236 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 240 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 260 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  46.67 
 
 		 707 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  49.1 
 
 		 227 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  41.96 
 
 		 234 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.31 
 
 		 654 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  43.81 
 
 		 235 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.84 
 
 		 230 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  43.04 
 
 		 233 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 238 aa  171  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 241 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  47.79 
 
 		 226 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.22 
 
 		 241 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 228 aa  171  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 228 aa  171  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  45.21 
 
 		 228 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.44 
 
 		 225 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 230 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 233 aa  170  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  44.3 
 
 		 258 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  170  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  170  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  170  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 		 227 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  42.98 
 
 		 230 aa  170  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  40.67 
 
 		 650 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  46.15 
 
 		 230 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  42.73 
 
 		 235 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>