More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4631 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
419 aa  853    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.52 
 
 
413 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.23 
 
 
412 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  34.64 
 
 
410 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.86 
 
 
419 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 
414 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.28 
 
 
409 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.73 
 
 
391 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.66 
 
 
409 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.38 
 
 
409 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.48 
 
 
653 aa  186  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  32.7 
 
 
657 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.23 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
405 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 
405 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 
405 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  32.52 
 
 
409 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  32.52 
 
 
409 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
414 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  30.53 
 
 
398 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
406 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  29.33 
 
 
427 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  30.35 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.04 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  30.35 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.84 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.71 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  33.72 
 
 
411 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.54 
 
 
409 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.33 
 
 
409 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
406 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 
409 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 
409 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.62 
 
 
656 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
406 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
410 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.66 
 
 
407 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.03 
 
 
657 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 
392 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  31.52 
 
 
707 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
415 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.48 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
416 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.32 
 
 
409 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.98 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  29.63 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.55 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.21 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  31.24 
 
 
420 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  27.7 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.81 
 
 
409 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 
405 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.85 
 
 
394 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.73 
 
 
417 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  28.85 
 
 
653 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 
409 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.17 
 
 
658 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.95 
 
 
403 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.96 
 
 
437 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.31 
 
 
413 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  28.71 
 
 
657 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 
405 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 
421 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.02 
 
 
652 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  30.3 
 
 
414 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.44 
 
 
401 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 
411 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  28.44 
 
 
418 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.19 
 
 
670 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.25 
 
 
443 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  31.98 
 
 
408 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
397 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.98 
 
 
401 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.98 
 
 
401 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  27.63 
 
 
421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.41 
 
 
399 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.98 
 
 
420 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.98 
 
 
414 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.47 
 
 
410 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.03 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.58 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  29.98 
 
 
414 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.99 
 
 
412 aa  153  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.16 
 
 
400 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.9 
 
 
646 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.23 
 
 
647 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
406 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.19 
 
 
415 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.14 
 
 
648 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  30.64 
 
 
404 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 
395 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.74 
 
 
400 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.14 
 
 
648 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  28.01 
 
 
456 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.57 
 
 
656 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>