More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3520 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
416 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  43.51 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  41.33 
 
 
418 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  41.01 
 
 
414 aa  319  5e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  41.01 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  39.72 
 
 
421 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  39.05 
 
 
419 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  39.67 
 
 
419 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  37.23 
 
 
420 aa  237  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  32.94 
 
 
424 aa  228  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 
410 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 
412 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 
414 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.46 
 
 
409 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.47 
 
 
419 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
406 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.8 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.88 
 
 
409 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
405 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  30.49 
 
 
404 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 
415 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.34 
 
 
414 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.92 
 
 
400 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.24 
 
 
656 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  31.86 
 
 
408 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 
405 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
405 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
405 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
405 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
405 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.47 
 
 
394 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.93 
 
 
419 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  29.9 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.84 
 
 
407 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.33 
 
 
409 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.14 
 
 
409 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.23 
 
 
410 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.16 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.73 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.1 
 
 
658 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  28.43 
 
 
657 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  26.73 
 
 
410 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.66 
 
 
394 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.48 
 
 
400 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.56 
 
 
408 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  29.91 
 
 
657 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.14 
 
 
651 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.72 
 
 
657 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  26.49 
 
 
405 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
402 aa  143  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  30.02 
 
 
653 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.33 
 
 
405 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  28.67 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
410 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
398 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.68 
 
 
443 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  27.82 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.44 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.47 
 
 
403 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  29.09 
 
 
657 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.12 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
405 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.57 
 
 
409 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.72 
 
 
653 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.57 
 
 
409 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
409 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
409 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.18 
 
 
645 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  27.71 
 
 
653 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.46 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.92 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  28.54 
 
 
652 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.61 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  29.86 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  28.92 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.04 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  30.34 
 
 
414 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.78 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.78 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.13 
 
 
399 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.02 
 
 
401 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.27 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.03 
 
 
654 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.47 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.23 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 
418 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
408 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28 
 
 
644 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>