More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01130 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  100 
 
 		 414 aa  843    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  59.66 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  41.01 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  40.33 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  38.68 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  37 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  36.66 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  40.14 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  34.19 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  29.84 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.33 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.93 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  26.33 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.34 
 
 		 412 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.39 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.38 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  26.39 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.08 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.29 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.04 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.1 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  25.69 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.59 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  24.41 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.51 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.82 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.76 
 
 		 409 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.54 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  27.86 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.82 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.54 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  27.29 
 
 		 657 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  24.7 
 
 		 656 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  27.19 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  26.63 
 
 		 657 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  25.41 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.62 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.37 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.4 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  27.55 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  25.54 
 
 		 657 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  25.55 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  28.01 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  25.35 
 
 		 670 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.18 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  24.11 
 
 		 653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  26.06 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.7 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.29 
 
 		 658 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.79 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  27.83 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  24.82 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.87 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  24.2 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  24.83 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.41 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  24.7 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.6 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  24.7 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  28.07 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.47 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  27.38 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.6 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>