More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1664 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 424 aa  875    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  32.05 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  33.64 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  31.41 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  35.86 
 
 		 419 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  29.84 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  28.64 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  30.09 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.22 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  31.46 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 410 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.41 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.87 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.02 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.44 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  29.07 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  26.98 
 
 		 427 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.24 
 
 		 658 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.44 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  29.52 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  25.65 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.36 
 
 		 681 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.36 
 
 		 681 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.23 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.73 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  27.49 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  26.48 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.53 
 
 		 656 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  26.35 
 
 		 696 aa  116  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  26.71 
 
 		 687 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.91 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.79 
 
 		 644 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  29.02 
 
 		 653 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  25.12 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.82 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.28 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  27.03 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  26.79 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  25.47 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.93 
 
 		 653 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.3 
 
 		 653 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.14 
 
 		 657 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.87 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  26.81 
 
 		 657 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 406 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  26.86 
 
 		 656 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.38 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  27.02 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.9 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.25 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.54 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  26.79 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.18 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.12 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.97 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.46 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.08 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.05 
 
 		 645 aa  106  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  25.93 
 
 		 651 aa  106  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.63 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.41 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.9 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.65 
 
 		 648 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  28.84 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  28.84 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.84 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.54 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.84 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  28.84 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  25.23 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.53 
 
 		 648 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.24 
 
 		 657 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>