More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00555 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  100 
 
 		 417 aa  829    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  63.79 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  55.05 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  43.13 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  44.29 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  34.47 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  34.2 
 
 		 421 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  33.74 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  34.87 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  34.06 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  33.41 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.35 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.94 
 
 		 401 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.51 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.35 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.34 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.64 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.64 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.93 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.18 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  31.05 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.65 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.7 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  31.31 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.73 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.64 
 
 		 409 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.03 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.12 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.83 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.48 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.48 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.91 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.7 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.91 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  31.5 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.22 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  31.59 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.33 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.46 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.46 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.39 
 
 		 647 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.73 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.05 
 
 		 641 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  30.58 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  29.69 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  28.85 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.55 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.98 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.62 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  30.11 
 
 		 410 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  28.3 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  31.03 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.47 
 
 		 653 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.74 
 
 		 642 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.04 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  27.91 
 
 		 668 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  27.91 
 
 		 668 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  29.72 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.29 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>