More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1668 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  837    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  59.66 
 
 
414 aa  529  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  41.01 
 
 
416 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  39.24 
 
 
416 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  39.15 
 
 
418 aa  292  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  37.67 
 
 
421 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  36.98 
 
 
419 aa  262  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  37.79 
 
 
419 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  33.87 
 
 
420 aa  210  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  31.41 
 
 
424 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
405 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
405 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.79 
 
 
413 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.5 
 
 
409 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
405 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
414 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.44 
 
 
409 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.91 
 
 
409 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.5 
 
 
414 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
410 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.4 
 
 
419 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.34 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.46 
 
 
443 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.77 
 
 
419 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.05 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.05 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  27.56 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.79 
 
 
656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.32 
 
 
410 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 
400 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.59 
 
 
410 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.23 
 
 
657 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.89 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
405 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.05 
 
 
412 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  25.48 
 
 
401 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  25.73 
 
 
400 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
409 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
405 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  26.52 
 
 
394 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.47 
 
 
409 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 
403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  27.12 
 
 
657 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  24.48 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.08 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  24.35 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  24.03 
 
 
402 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.25 
 
 
407 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.3 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  24.47 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  26.9 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.79 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 
406 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  24.46 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  24.46 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  26.32 
 
 
670 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.3 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.02 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.5 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  25.87 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
406 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.47 
 
 
405 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  27.46 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  27.01 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  27.82 
 
 
395 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
392 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
423 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  26.05 
 
 
405 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  24.94 
 
 
653 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  25.42 
 
 
414 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.67 
 
 
408 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 
406 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  25.54 
 
 
394 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
415 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  26.41 
 
 
410 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27 
 
 
641 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.5 
 
 
427 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
403 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  27.54 
 
 
413 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.15 
 
 
657 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  25.18 
 
 
404 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.76 
 
 
641 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  26.86 
 
 
414 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.94 
 
 
400 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
408 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.91 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.24 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  26.46 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.24 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  23.23 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
409 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>