More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5053 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  827    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  65.94 
 
 
414 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  56.66 
 
 
413 aa  482  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  44.01 
 
 
410 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 
414 aa  292  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  42.09 
 
 
412 aa  279  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  37.68 
 
 
423 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  37.96 
 
 
407 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  35.86 
 
 
420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 
410 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
411 aa  222  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  32.13 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  32.54 
 
 
411 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
410 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  35.84 
 
 
411 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
417 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.83 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
421 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
413 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
420 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 
413 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.4 
 
 
413 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.22 
 
 
391 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  29.23 
 
 
415 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
420 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.86 
 
 
410 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
412 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  30 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.74 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.27 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  32.08 
 
 
414 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.4 
 
 
437 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.54 
 
 
417 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.95 
 
 
401 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 
406 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.05 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  26.88 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  28.61 
 
 
420 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.81 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  27.85 
 
 
421 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 
415 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.73 
 
 
401 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
416 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.51 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.51 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
406 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.64 
 
 
410 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.64 
 
 
400 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
414 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
421 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.85 
 
 
410 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  32.94 
 
 
414 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  29.05 
 
 
421 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
401 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.93 
 
 
409 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.81 
 
 
658 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.9 
 
 
407 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.67 
 
 
403 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30.7 
 
 
408 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.66 
 
 
402 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 
401 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.64 
 
 
401 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 
409 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.3 
 
 
403 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
402 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.29 
 
 
402 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.2 
 
 
394 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.23 
 
 
409 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
400 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
400 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.14 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.85 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 
406 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  28.5 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
415 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.6 
 
 
400 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
392 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.4 
 
 
394 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
406 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 
415 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.43 
 
 
405 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  27.85 
 
 
652 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.25 
 
 
402 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.51 
 
 
413 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
417 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.31 
 
 
656 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30 
 
 
647 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.94 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.94 
 
 
667 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.88 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.7 
 
 
682 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.63 
 
 
406 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
413 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.46 
 
 
653 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>