More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1637 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
411 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  71.53 
 
 
420 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  69.59 
 
 
411 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  75.98 
 
 
417 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  70.07 
 
 
411 aa  569  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  65.94 
 
 
410 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  66.67 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  49.51 
 
 
408 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  41.03 
 
 
407 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  37.98 
 
 
412 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 
414 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  35.19 
 
 
410 aa  242  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  36.12 
 
 
409 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  36.8 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
423 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
413 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
413 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  33.82 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
412 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  32.93 
 
 
414 aa  219  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 
411 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  34.06 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  34.22 
 
 
420 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
406 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 
415 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 
413 aa  206  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.57 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
405 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  34.4 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 
406 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  33.5 
 
 
403 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.98 
 
 
410 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33.83 
 
 
391 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  32.05 
 
 
414 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  32.07 
 
 
400 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.49 
 
 
420 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.47 
 
 
437 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.63 
 
 
405 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.4 
 
 
405 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.17 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
409 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.55 
 
 
405 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 
413 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 
405 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  32.3 
 
 
402 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
421 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.37 
 
 
405 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.64 
 
 
413 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
414 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 
400 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  32.23 
 
 
415 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
408 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.09 
 
 
409 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.25 
 
 
409 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  34.22 
 
 
408 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.6 
 
 
410 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 
400 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.6 
 
 
410 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.46 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.54 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  32.28 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.88 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  32.07 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  33.1 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.64 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.64 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.07 
 
 
407 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.65 
 
 
658 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 
409 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.85 
 
 
647 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 
409 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.76 
 
 
394 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
401 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  30.41 
 
 
423 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.81 
 
 
398 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  34.2 
 
 
415 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
417 aa  170  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.33 
 
 
653 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.45 
 
 
400 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.1 
 
 
400 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  31.65 
 
 
404 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  31.65 
 
 
404 aa  169  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  31.22 
 
 
404 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.18 
 
 
401 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  30.5 
 
 
417 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
406 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  32.53 
 
 
656 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
405 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  31.68 
 
 
411 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.77 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  30.58 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>