More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0990 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  100 
 
 
411 aa  829    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  69.59 
 
 
411 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  65.21 
 
 
420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  65.68 
 
 
411 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  66.18 
 
 
417 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  63.99 
 
 
410 aa  522  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  61.31 
 
 
410 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  51.46 
 
 
408 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  40.88 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
410 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  35.42 
 
 
409 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
423 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 
412 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 
414 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 
412 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
413 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  33.41 
 
 
413 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  35.04 
 
 
420 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.47 
 
 
420 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  33.58 
 
 
410 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
420 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  32.84 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
413 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  32.54 
 
 
414 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.84 
 
 
411 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
415 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  35.68 
 
 
406 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  34.36 
 
 
403 aa  199  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.53 
 
 
410 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.1 
 
 
437 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
406 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
405 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 
406 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  32.53 
 
 
414 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
409 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
421 aa  187  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
392 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 
405 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  31.64 
 
 
406 aa  186  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.85 
 
 
409 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.23 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  34.55 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.45 
 
 
405 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.01 
 
 
409 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.98 
 
 
410 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.83 
 
 
415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
400 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.98 
 
 
410 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.13 
 
 
678 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  32.13 
 
 
678 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  32.13 
 
 
678 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
401 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
417 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.99 
 
 
421 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
405 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 
402 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.39 
 
 
402 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 
405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 
405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.66 
 
 
409 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 
406 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.19 
 
 
398 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  31.23 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  32.76 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.65 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.57 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.59 
 
 
417 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
414 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33.25 
 
 
391 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 
415 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
387 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  31.72 
 
 
421 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 
413 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  32.2 
 
 
415 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.2 
 
 
400 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.8 
 
 
401 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  30.33 
 
 
414 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  31.16 
 
 
409 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
403 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  29.86 
 
 
414 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.04 
 
 
413 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.12 
 
 
394 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.81 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.28 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  33.42 
 
 
412 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  30.43 
 
 
404 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.99 
 
 
400 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  30.43 
 
 
404 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.67 
 
 
402 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.36 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  38.41 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>