More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1640 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  816    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  51.46 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  49.51 
 
 
411 aa  398  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  48.54 
 
 
420 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  48.78 
 
 
410 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  50.98 
 
 
411 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
417 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  48.89 
 
 
410 aa  361  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  45.37 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  41.32 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 
413 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  39.47 
 
 
412 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  39.37 
 
 
413 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  34.63 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
423 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.56 
 
 
411 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  37.32 
 
 
410 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  36.47 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
413 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  36.76 
 
 
416 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  35.52 
 
 
392 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.14 
 
 
420 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 
415 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
412 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  32.13 
 
 
414 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  34.64 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  35.17 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.15 
 
 
410 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
420 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  36.73 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  34.55 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.49 
 
 
405 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  33.66 
 
 
415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.14 
 
 
391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
414 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
406 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  36.25 
 
 
394 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 
401 aa  209  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  36.09 
 
 
414 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  34.14 
 
 
400 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  35.42 
 
 
403 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  36.32 
 
 
414 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  35.75 
 
 
412 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  35.02 
 
 
405 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
403 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  35.22 
 
 
405 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 
415 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 
398 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.77 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.77 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  34.29 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
406 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.13 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  34.52 
 
 
410 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.92 
 
 
401 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
413 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  34.37 
 
 
398 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
405 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  31.07 
 
 
414 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  36.61 
 
 
404 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  34.59 
 
 
409 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  35.75 
 
 
394 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  35.58 
 
 
405 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.95 
 
 
412 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  32.09 
 
 
400 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  33.17 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  33.66 
 
 
400 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  32.6 
 
 
409 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  30.94 
 
 
417 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  32.6 
 
 
409 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.62 
 
 
400 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.37 
 
 
409 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.45 
 
 
409 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  34.89 
 
 
409 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 
417 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
421 aa  186  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.28 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  33.25 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.01 
 
 
653 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.13 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  32.42 
 
 
656 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  35.41 
 
 
407 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
403 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  30.29 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
413 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 
418 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
410 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  32.2 
 
 
409 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  29.26 
 
 
421 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.31 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.66 
 
 
443 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>