More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0998 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  77.07 
 
 
410 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
410 aa  823    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  65.94 
 
 
411 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  62.29 
 
 
420 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  64.23 
 
 
411 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  61.31 
 
 
411 aa  511  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  64.22 
 
 
417 aa  501  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  48.78 
 
 
408 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  41.02 
 
 
407 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  35.63 
 
 
409 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  35.87 
 
 
413 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
414 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
412 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 
410 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  35.38 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  35.11 
 
 
414 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  36.87 
 
 
412 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  32.19 
 
 
410 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 
416 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
423 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
412 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 
420 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.59 
 
 
420 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  35.41 
 
 
406 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  32.19 
 
 
420 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 
405 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.89 
 
 
411 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
413 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
392 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  31.81 
 
 
414 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33.81 
 
 
391 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 
420 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 
402 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.81 
 
 
402 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 
406 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
406 aa  189  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.54 
 
 
437 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
405 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.87 
 
 
653 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  32.01 
 
 
403 aa  186  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.6 
 
 
410 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  33.91 
 
 
656 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  33.25 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  33.66 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.85 
 
 
409 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.74 
 
 
409 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.14 
 
 
409 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  33.25 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.79 
 
 
405 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.06 
 
 
405 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  34.36 
 
 
415 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.25 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.86 
 
 
410 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.9 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.09 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
405 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  33.66 
 
 
413 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
405 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 
405 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.9 
 
 
385 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 
405 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
404 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  33.33 
 
 
657 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  32.21 
 
 
644 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  30.77 
 
 
415 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.64 
 
 
647 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  36.32 
 
 
670 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.49 
 
 
408 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.63 
 
 
409 aa  176  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  33.95 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.73 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.37 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.62 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.15 
 
 
658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.5 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  32.87 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.23 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 
400 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  31.39 
 
 
423 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.61 
 
 
407 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  33.17 
 
 
401 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
409 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.79 
 
 
401 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.84 
 
 
678 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 
409 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.84 
 
 
678 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.73 
 
 
400 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  33.97 
 
 
411 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.84 
 
 
678 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
409 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>