More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7003 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 423 aa  842    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  44.68 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  43.66 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  41.96 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  37.91 
 
 		 414 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  40.24 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  35.48 
 
 		 408 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  33.73 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  31.6 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  32.05 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  32.32 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.15 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  31.13 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.41 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.4 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  31.83 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.95 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.53 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.29 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 		 412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.83 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.36 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  27.73 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.97 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.61 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  28.87 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.38 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  29.29 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  29 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.08 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.08 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.85 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.44 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.53 
 
 		 405 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.93 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.91 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.2 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  32.63 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.3 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  29.77 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.3 
 
 		 656 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  29.95 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.31 
 
 		 399 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  27.46 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 409 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.68 
 
 		 647 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  25.21 
 
 		 715 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.64 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.18 
 
 		 658 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.81 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  34.83 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.45 
 
 		 653 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.58 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  29.26 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.14 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  29.09 
 
 		 670 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.7 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.7 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.5 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.7 
 
 		 678 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.7 
 
 		 678 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29.7 
 
 		 678 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.1 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>