More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1780 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 413 aa  827    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  56.66 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  56.76 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  43.24 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  39.76 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  40.92 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  37.2 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  32.93 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  33.09 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  32.77 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  32.93 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.43 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.71 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.16 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.92 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.61 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.5 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.87 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 412 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  27.18 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.85 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  28.16 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.07 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  28.09 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  32.46 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.23 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.76 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.76 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 406 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.15 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.4 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.19 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.05 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.26 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.17 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.87 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.9 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.85 
 
 		 405 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.1 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.64 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  32.27 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  32.27 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  32.27 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.29 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.89 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.56 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  32.27 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.53 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.19 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.8 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.25 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.02 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.68 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.19 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  27.29 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.66 
 
 		 657 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  25.93 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.57 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.12 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>