More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2570 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
413 aa  831    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  49.76 
 
 
413 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  47.6 
 
 
414 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  43 
 
 
415 aa  345  7e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  44.66 
 
 
417 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  43.96 
 
 
415 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  43.13 
 
 
417 aa  338  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  37.62 
 
 
417 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  37.26 
 
 
421 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
421 aa  241  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  35.84 
 
 
421 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  34.21 
 
 
421 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  35.02 
 
 
415 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  35.38 
 
 
404 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
417 aa  219  7.999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
420 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  32.05 
 
 
420 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.03 
 
 
437 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  32.12 
 
 
408 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  31.31 
 
 
420 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.35 
 
 
409 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
405 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.25 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.52 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 
413 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  32.93 
 
 
414 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.01 
 
 
410 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.14 
 
 
401 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
406 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  32.69 
 
 
414 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 
401 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 
409 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.03 
 
 
409 aa  170  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 
406 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 
409 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
400 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.72 
 
 
409 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.1 
 
 
420 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.12 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.74 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.8 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.02 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  32.3 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.74 
 
 
409 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.12 
 
 
394 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.06 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  28.11 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  28.85 
 
 
414 aa  163  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 
406 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.83 
 
 
403 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 
416 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
405 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
405 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
413 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.19 
 
 
409 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.46 
 
 
644 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.41 
 
 
394 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
405 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30 
 
 
410 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.43 
 
 
413 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
411 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.17 
 
 
656 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  30.09 
 
 
409 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  29.18 
 
 
420 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.71 
 
 
402 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  30.09 
 
 
409 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.13 
 
 
401 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 
418 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.12 
 
 
647 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  29.58 
 
 
411 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.32 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 
409 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  27.75 
 
 
414 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
410 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
417 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.24 
 
 
667 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  30.29 
 
 
411 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.35 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  29.18 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.48 
 
 
408 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  30.37 
 
 
410 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.49 
 
 
667 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  30.81 
 
 
398 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.02 
 
 
394 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.9 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.24 
 
 
682 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  30.24 
 
 
682 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 
404 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  31.07 
 
 
404 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>