More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1336 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  914    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2954  protein of unknown function DUF214  57.34 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0954365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0797  hypothetical protein  56.19 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0268  ABC-type transport system, permease component  53.28 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  34.65 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  29.41 
 
 		 663 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.96 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.94 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.48 
 
 		 657 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 406 aa  187  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.92 
 
 		 663 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.66 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 654 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  31.78 
 
 		 656 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 		 409 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  32.69 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.09 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.69 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  30.37 
 
 		 654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 405 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  28.74 
 
 		 657 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  30.48 
 
 		 654 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.35 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.86 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 		 658 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.12 
 
 		 656 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  30.37 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.6 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.18 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  28.26 
 
 		 715 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.04 
 
 		 644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.14 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.64 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.73 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.5 
 
 		 657 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  32.11 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.27 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.37 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.25 
 
 		 656 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  32.25 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.65 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  30.02 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.75 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.98 
 
 		 645 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  32.75 
 
 		 657 aa  169  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.58 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.84 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  30.68 
 
 		 653 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  30.64 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.08 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.19 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.12 
 
 		 651 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  31.19 
 
 		 646 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.28 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.1 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  29.78 
 
 		 666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  31.74 
 
 		 670 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  28.98 
 
 		 661 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  28.28 
 
 		 647 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.66 
 
 		 657 aa  163  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.02 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  27.99 
 
 		 651 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.14 
 
 		 653 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.75 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  30.37 
 
 		 671 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  24.94 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  31.39 
 
 		 668 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  31.39 
 
 		 668 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.32 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  29.58 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 400 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  30.85 
 
 		 648 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.84 
 
 		 649 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  28.04 
 
 		 668 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.21 
 
 		 653 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.27 
 
 		 681 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.27 
 
 		 681 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>