More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1535 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  75.98 
 
 		 411 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 417 aa  842    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  71.81 
 
 		 420 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  70.27 
 
 		 411 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  66.18 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  68.37 
 
 		 410 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  64.22 
 
 		 410 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  50 
 
 		 408 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 		 407 aa  296  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  36.5 
 
 		 409 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  34.06 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  37.05 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 415 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 412 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  32.69 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.7 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  32.27 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.68 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  32.69 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  32.22 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.92 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.88 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  32.19 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  32.2 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.25 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.19 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.1 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.46 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.07 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.15 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.83 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.39 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.98 
 
 		 409 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.41 
 
 		 401 aa  186  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  32.69 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.83 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  32.12 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.98 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.76 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.92 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.63 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.76 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.64 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.75 
 
 		 405 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  32.27 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.6 
 
 		 678 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.6 
 
 		 678 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.6 
 
 		 678 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  31.21 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.48 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.4 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.56 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.58 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 		 404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.19 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.96 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  29.76 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.29 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  29.01 
 
 		 715 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  31.57 
 
 		 657 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.79 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.36 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.1 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.88 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.91 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.37 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.1 
 
 		 647 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  32.19 
 
 		 644 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>