More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5607 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
414 aa  823    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0794  protein of unknown function DUF214  60.1 
 
 
412 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  43.51 
 
 
410 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  41.36 
 
 
423 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  39.76 
 
 
413 aa  316  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  39.86 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  40.38 
 
 
414 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 
411 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
410 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  36.06 
 
 
420 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  36.47 
 
 
408 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  36.3 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  36.87 
 
 
410 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  35.35 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  36.78 
 
 
411 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
407 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
412 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 
413 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  33.72 
 
 
420 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  31.57 
 
 
413 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  30.51 
 
 
417 aa  182  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
406 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.73 
 
 
415 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.18 
 
 
391 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.35 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.07 
 
 
410 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  30.92 
 
 
421 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
417 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
421 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.88 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.77 
 
 
403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.7 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.31 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  29.36 
 
 
415 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
406 aa  169  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  29.93 
 
 
404 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.39 
 
 
409 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
421 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.13 
 
 
400 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.19 
 
 
411 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  31.75 
 
 
414 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.9 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 
410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 
400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.76 
 
 
401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  31.26 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.4 
 
 
401 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
412 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
414 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.52 
 
 
437 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  31.35 
 
 
409 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.48 
 
 
400 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.88 
 
 
403 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.29 
 
 
394 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 
403 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.68 
 
 
405 aa  159  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  30.71 
 
 
404 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  30.71 
 
 
404 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  33.09 
 
 
652 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
406 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
454 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 
413 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  31.89 
 
 
394 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.83 
 
 
410 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.41 
 
 
400 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 
413 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.02 
 
 
407 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.2 
 
 
413 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.3 
 
 
412 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.52 
 
 
647 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.02 
 
 
402 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 
397 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.67 
 
 
401 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.67 
 
 
401 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.36 
 
 
658 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.95 
 
 
420 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  30.62 
 
 
393 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  28.44 
 
 
410 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.65 
 
 
409 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 
431 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  30.44 
 
 
415 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>