More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3939 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
414 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  67.8 
 
 
413 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  47.6 
 
 
413 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  42.48 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 
415 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  41.11 
 
 
415 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  41.19 
 
 
417 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  34.36 
 
 
421 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  33.96 
 
 
417 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  32.15 
 
 
421 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
420 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  34.14 
 
 
420 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  32.35 
 
 
408 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.48 
 
 
415 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
420 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
421 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  32 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  32.85 
 
 
420 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  32.2 
 
 
409 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  31.98 
 
 
420 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 
417 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.81 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
416 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
417 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  32.37 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  31.93 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.78 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.9 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 
407 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
415 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.3 
 
 
391 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 
405 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
411 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 
413 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.64 
 
 
400 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.88 
 
 
400 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  31.53 
 
 
411 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
413 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.07 
 
 
644 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
401 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
400 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.49 
 
 
394 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
394 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
400 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
392 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.93 
 
 
403 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.22 
 
 
409 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.13 
 
 
401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  31.91 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
406 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.02 
 
 
403 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.36 
 
 
401 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.78 
 
 
412 aa  163  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 
406 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 
410 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 
398 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.04 
 
 
405 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  29.23 
 
 
414 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  29.04 
 
 
405 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
410 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.06 
 
 
405 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
406 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  30.36 
 
 
423 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.36 
 
 
412 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 
406 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.68 
 
 
410 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  27.92 
 
 
414 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
405 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.47 
 
 
400 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
406 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.16 
 
 
411 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  27.82 
 
 
401 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  27.82 
 
 
401 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.72 
 
 
402 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.16 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.86 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.61 
 
 
409 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.88 
 
 
409 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.14 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.92 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  28.37 
 
 
671 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.33 
 
 
643 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  30.77 
 
 
417 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.16 
 
 
413 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.5 
 
 
407 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
403 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 
654 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>