More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8341 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
394 aa  766    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  59.39 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  58.99 
 
 
395 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  56.28 
 
 
398 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  43.7 
 
 
409 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  43.14 
 
 
409 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  41.87 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.31 
 
 
409 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  40.65 
 
 
407 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 
405 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  39.56 
 
 
405 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 
405 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  39.11 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.84 
 
 
405 aa  269  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  41.03 
 
 
443 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  38.92 
 
 
406 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  36.86 
 
 
410 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  36.86 
 
 
410 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  37.81 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  37.81 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  37.09 
 
 
398 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  37.31 
 
 
409 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 
405 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.22 
 
 
394 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 
405 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 
405 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 
405 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  36.91 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  38.54 
 
 
405 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 
415 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  39.49 
 
 
414 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  36.2 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  38.81 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  39.58 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  38.79 
 
 
652 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  36.65 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 
409 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  36.79 
 
 
401 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 
406 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  37.72 
 
 
399 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 
406 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40 
 
 
411 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  41.18 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  35.4 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  38.92 
 
 
410 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
654 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  34.83 
 
 
403 aa  233  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  36.39 
 
 
409 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  36.57 
 
 
682 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  36.27 
 
 
678 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  36.32 
 
 
392 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  36.27 
 
 
678 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.16 
 
 
401 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  36.57 
 
 
682 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.27 
 
 
678 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
404 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.32 
 
 
667 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.31 
 
 
644 aa  229  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  35.93 
 
 
647 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.32 
 
 
667 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.83 
 
 
642 aa  226  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  39.95 
 
 
401 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  39.95 
 
 
401 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.39 
 
 
653 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  38.31 
 
 
657 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  36.57 
 
 
402 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  37.35 
 
 
409 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  35.82 
 
 
656 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.65 
 
 
412 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.19 
 
 
651 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 
400 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  34.81 
 
 
402 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  39.11 
 
 
402 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.1 
 
 
648 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.1 
 
 
648 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  36.51 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  35.38 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  36.97 
 
 
657 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  36.04 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  37.22 
 
 
399 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 
409 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 
409 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  35.14 
 
 
404 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  37.78 
 
 
410 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.37 
 
 
671 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.01 
 
 
653 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  36.62 
 
 
400 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  37.28 
 
 
652 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 
656 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  35.5 
 
 
402 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.19 
 
 
661 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.84 
 
 
653 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  34.8 
 
 
408 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  34.86 
 
 
400 aa  216  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  37.63 
 
 
652 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.03 
 
 
663 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  37.78 
 
 
656 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.27 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>