More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3519 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
416 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  45.84 
 
 
421 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  47.74 
 
 
418 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  46.06 
 
 
419 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  43.51 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  40.33 
 
 
414 aa  306  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  39.24 
 
 
414 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  40.94 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  38.24 
 
 
420 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.49 
 
 
413 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  31.94 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.14 
 
 
412 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
410 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.45 
 
 
419 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.65 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.64 
 
 
409 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.67 
 
 
410 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.23 
 
 
398 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.19 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.55 
 
 
409 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.03 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
405 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
405 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.29 
 
 
407 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
405 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.01 
 
 
401 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.33 
 
 
409 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 
415 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
406 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.63 
 
 
696 aa  154  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
406 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  34.34 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.42 
 
 
409 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
405 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
654 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
405 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
395 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.95 
 
 
409 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
400 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.95 
 
 
409 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
414 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.04 
 
 
656 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  31.27 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.51 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  30.52 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.91 
 
 
417 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.37 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  28.98 
 
 
409 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 
409 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 
412 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.91 
 
 
409 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
404 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.97 
 
 
657 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 
409 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.11 
 
 
400 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
400 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  25.93 
 
 
427 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  29.64 
 
 
402 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.22 
 
 
405 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  31.3 
 
 
653 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
403 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.01 
 
 
437 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.49 
 
 
401 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.23 
 
 
413 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.18 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  28.74 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  26.99 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.37 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  26.54 
 
 
402 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  32.32 
 
 
414 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.64 
 
 
400 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  30.43 
 
 
403 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.37 
 
 
408 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.68 
 
 
657 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.34 
 
 
413 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.71 
 
 
402 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.88 
 
 
414 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.99 
 
 
401 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.23 
 
 
427 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.6 
 
 
654 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.99 
 
 
653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.1 
 
 
651 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.49 
 
 
656 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.06 
 
 
647 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.57 
 
 
401 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.73 
 
 
400 aa  136  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
401 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.99 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  31.19 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.95 
 
 
657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  26.28 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>