More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0469 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
405 aa  797    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  53.33 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  38.21 
 
 
400 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
397 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  33.66 
 
 
401 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  34.96 
 
 
394 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 
406 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  35.84 
 
 
405 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.61 
 
 
391 aa  223  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  36.1 
 
 
652 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  34.81 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 
405 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 
405 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  34.07 
 
 
402 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.22 
 
 
443 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  33.9 
 
 
409 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.93 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  34.93 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 
415 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  34.2 
 
 
414 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 
395 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.2 
 
 
409 aa  209  8e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  34.12 
 
 
410 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.82 
 
 
409 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
398 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  33.97 
 
 
408 aa  206  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  33.73 
 
 
414 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.58 
 
 
398 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
401 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.17 
 
 
405 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  32.53 
 
 
409 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  33.49 
 
 
409 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
409 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  33.49 
 
 
409 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.7 
 
 
405 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.31 
 
 
412 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  30.79 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.86 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.86 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  31.44 
 
 
452 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.7 
 
 
400 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  31.96 
 
 
409 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  33.17 
 
 
409 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  35.89 
 
 
653 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  33.97 
 
 
409 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  33.17 
 
 
667 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  33.17 
 
 
667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  31.65 
 
 
670 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.51 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  32.93 
 
 
682 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  32.93 
 
 
682 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  33.09 
 
 
407 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.25 
 
 
653 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
405 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  35.25 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  35.25 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.71 
 
 
656 aa  196  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  32.35 
 
 
647 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  34.86 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
409 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.44 
 
 
403 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31 
 
 
400 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.51 
 
 
658 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
392 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 
406 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.19 
 
 
402 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
402 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  35.01 
 
 
399 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.32 
 
 
412 aa  192  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  36.12 
 
 
400 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.68 
 
 
405 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.18 
 
 
653 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  31.53 
 
 
696 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  32.28 
 
 
668 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  32.28 
 
 
668 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 
411 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.8 
 
 
648 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  34.3 
 
 
652 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  34.07 
 
 
668 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.75 
 
 
403 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.78 
 
 
642 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  34.78 
 
 
400 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.25 
 
 
648 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  34.38 
 
 
398 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  34.78 
 
 
400 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  34.78 
 
 
400 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  28.54 
 
 
408 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  35.17 
 
 
400 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  31.2 
 
 
657 aa  189  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.82 
 
 
641 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>