More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1761 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  53.33 
 
 		 405 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  36.34 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.94 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33.97 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  33.99 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  34.87 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  33.42 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  33.74 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.28 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.52 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.28 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.81 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  33.09 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.71 
 
 		 647 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  32.2 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.3 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.4 
 
 		 658 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.34 
 
 		 667 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.39 
 
 		 656 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.34 
 
 		 667 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.68 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.1 
 
 		 656 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.1 
 
 		 682 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  30.1 
 
 		 682 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.87 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.63 
 
 		 649 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.33 
 
 		 653 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.68 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.1 
 
 		 647 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  35.27 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  35.27 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  32.52 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.77 
 
 		 650 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  33.01 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  31.8 
 
 		 652 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  33.17 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  33.01 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.78 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  34.14 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.13 
 
 		 405 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  32.06 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  34.61 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.54 
 
 		 696 aa  186  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  30.42 
 
 		 668 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  30.42 
 
 		 668 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  33.58 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  33.58 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.83 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  31.03 
 
 		 670 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.41 
 
 		 648 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.4 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  29.2 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.68 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.12 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.8 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.41 
 
 		 648 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.73 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  34.95 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.13 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.36 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.78 
 
 		 653 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  31.68 
 
 		 655 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  31.74 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  35.25 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  33.73 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>