More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2282 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 418 aa  852    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  47.74 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  41.33 
 
 		 416 aa  322  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  39.9 
 
 		 419 aa  315  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  43.09 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  39.62 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  39.15 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  38.68 
 
 		 414 aa  282  7.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  35.63 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  33.64 
 
 		 424 aa  200  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.31 
 
 		 409 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.72 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.86 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.02 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.12 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.24 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.44 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.12 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.37 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.27 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.06 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.5 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.52 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.45 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.45 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.42 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.57 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.38 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.55 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  26.42 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  27.71 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  27.71 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  30.62 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.1 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 415 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.7 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.6 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.47 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.09 
 
 		 405 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  25.68 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.6 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.76 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  26.88 
 
 		 654 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 		 654 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.09 
 
 		 696 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.47 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  26.38 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  27.78 
 
 		 668 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.54 
 
 		 678 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  27.54 
 
 		 678 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.54 
 
 		 678 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  25.28 
 
 		 656 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  24.83 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  26.08 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 		 643 aa  123  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  26.49 
 
 		 654 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.57 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.27 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  26.81 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.56 
 
 		 658 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.4 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.63 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.16 
 
 		 641 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.73 
 
 		 647 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.97 
 
 		 647 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.6 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.1 
 
 		 641 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  28.05 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>