More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1172 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  867    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  61.97 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  61.27 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.15 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.76 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  25.69 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.71 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.37 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.71 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.8 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.55 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  26.45 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.75 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  25.64 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  24.83 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.9 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  23.84 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.71 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.88 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.48 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  27.57 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  27.7 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.84 
 
 		 641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  23.52 
 
 		 653 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  26.4 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  26.4 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  25.12 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  25.69 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  23.28 
 
 		 668 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.42 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  24.76 
 
 		 650 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.75 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  25.77 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  24.59 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  23.28 
 
 		 651 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  24.59 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  23.88 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  24.82 
 
 		 656 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  23.76 
 
 		 657 aa  106  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  27.44 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  26.29 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  26.22 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  26.39 
 
 		 657 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.58 
 
 		 658 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.96 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.89 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  23.58 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  24.7 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  24.7 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  22.51 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.04 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  22.82 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  23.29 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  23.29 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  24.53 
 
 		 646 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.28 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.11 
 
 		 653 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  24.01 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  25.47 
 
 		 668 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  25.47 
 
 		 668 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.1 
 
 		 663 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  25.17 
 
 		 656 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  23.22 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  24.47 
 
 		 676 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  23.22 
 
 		 650 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  26.45 
 
 		 671 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  22.61 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.58 
 
 		 652 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  23.57 
 
 		 654 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  24.65 
 
 		 653 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26.17 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  23.43 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.38 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.54 
 
 		 402 aa  99.8  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  25.23 
 
 		 663 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  22.97 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.34 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  22.97 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>