More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1791 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 394 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.73 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  35.89 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  34.65 
 
 		 668 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  34.16 
 
 		 681 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  34.16 
 
 		 681 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  33.66 
 
 		 656 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  33.83 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.57 
 
 		 649 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2050  peptide ABC transporter permease  34.6 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.32 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  34.41 
 
 		 687 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.59 
 
 		 642 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  33.17 
 
 		 682 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  33.17 
 
 		 682 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  33.17 
 
 		 667 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  33.33 
 
 		 667 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.82 
 
 		 656 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  33.16 
 
 		 651 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.92 
 
 		 648 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  34.32 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.83 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  32.43 
 
 		 652 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  31.63 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.33 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.5 
 
 		 653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.16 
 
 		 647 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  32.84 
 
 		 648 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  33.68 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  31.6 
 
 		 648 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  31.6 
 
 		 648 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0016  ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.25 
 
 		 653 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.33 
 
 		 648 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.41 
 
 		 648 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.33 
 
 		 648 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.41 
 
 		 648 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.33 
 
 		 648 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  32.83 
 
 		 653 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.22 
 
 		 646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.66 
 
 		 648 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  33 
 
 		 653 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.66 
 
 		 648 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  33.66 
 
 		 648 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 648 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.66 
 
 		 648 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.66 
 
 		 648 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  33.66 
 
 		 648 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.25 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.84 
 
 		 642 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  35.98 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.66 
 
 		 648 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  33.75 
 
 		 655 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 649 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30.25 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  31.94 
 
 		 650 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.37 
 
 		 647 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.18 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  32.51 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  32.51 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.84 
 
 		 641 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.19 
 
 		 658 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  32.79 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.42 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.1 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.71 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.78 
 
 		 696 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  30.47 
 
 		 408 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 		 643 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  31.7 
 
 		 652 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  32.78 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  33.82 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  34.5 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  33.82 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.85 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.22 
 
 		 657 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.42 
 
 		 650 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.71 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  31.05 
 
 		 668 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  31.05 
 
 		 668 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.93 
 
 		 644 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.17 
 
 		 641 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 646 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  33.17 
 
 		 641 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.19 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>