More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1541 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  91.33 
 
 
414 aa  766    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  95.66 
 
 
414 aa  792    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  825    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  78.55 
 
 
412 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  44.77 
 
 
435 aa  325  9e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  42.06 
 
 
414 aa  295  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
463 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  42.23 
 
 
414 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  30.32 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  30.07 
 
 
397 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
405 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.3 
 
 
443 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  31.59 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 
415 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  27.42 
 
 
394 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 
400 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  31.83 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  28.13 
 
 
682 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.37 
 
 
656 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  28.13 
 
 
682 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  28.13 
 
 
667 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  28.13 
 
 
667 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
405 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
405 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.81 
 
 
405 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.29 
 
 
391 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.59 
 
 
647 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
405 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  31.78 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  30.59 
 
 
397 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.27 
 
 
656 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 
406 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.72 
 
 
641 aa  143  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  30.17 
 
 
397 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  29.33 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  30.82 
 
 
397 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.08 
 
 
696 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  32.34 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.12 
 
 
398 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  31.41 
 
 
397 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.16 
 
 
642 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  29.81 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  31.55 
 
 
397 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  28.12 
 
 
653 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.64 
 
 
641 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.49 
 
 
409 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  27.7 
 
 
652 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 
405 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.12 
 
 
410 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.97 
 
 
407 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.64 
 
 
641 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.12 
 
 
410 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.05 
 
 
409 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.4 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.64 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.51 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.71 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.4 
 
 
648 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
397 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.04 
 
 
412 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
410 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  30.29 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  29.23 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.44 
 
 
409 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
409 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  29.67 
 
 
668 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.05 
 
 
648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.05 
 
 
648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  30.14 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  28.04 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.51 
 
 
665 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  30.02 
 
 
651 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 
643 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  29.29 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  27.27 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.75 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.16 
 
 
649 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.04 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.46 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.16 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.64 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.67 
 
 
402 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.04 
 
 
405 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  25.8 
 
 
411 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.86 
 
 
647 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  30.99 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  28.27 
 
 
653 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.26 
 
 
402 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.32 
 
 
394 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
392 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.68 
 
 
397 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>