More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1441 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 410 aa  812    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  48.18 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.64 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  31.77 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.77 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  33.42 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.09 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  29.9 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  32.52 
 
 		 404 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.55 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.71 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  31.58 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  28.77 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  27.25 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.13 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.93 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.99 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.05 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.75 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  28.81 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.17 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.86 
 
 		 656 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.84 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.38 
 
 		 682 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  30.38 
 
 		 682 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.14 
 
 		 667 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.38 
 
 		 656 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.62 
 
 		 667 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.77 
 
 		 653 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.35 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.48 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.89 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.46 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.85 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.78 
 
 		 647 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30.84 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  31.81 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  31.81 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.75 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.92 
 
 		 656 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  28.78 
 
 		 657 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.95 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.46 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  34.32 
 
 		 653 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  26.12 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.15 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.24 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  31.57 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  29.43 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  33.25 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.34 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.52 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.53 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  28.03 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  29.12 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.9 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.75 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  35.22 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.88 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.34 
 
 		 644 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.9 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.56 
 
 		 651 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  29.47 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 		 643 aa  156  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.76 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.92 
 
 		 648 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.92 
 
 		 648 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.62 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.75 
 
 		 663 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  31.16 
 
 		 646 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  33 
 
 		 671 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  28.61 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.75 
 
 		 657 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  29.06 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.72 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>