More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02836 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02836  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  840    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  80.75 
 
 		 400 aa  672    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  54.11 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 414 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.19 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.26 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.75 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.36 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.04 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.67 
 
 		 656 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  26.57 
 
 		 418 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  28.61 
 
 		 657 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.81 
 
 		 409 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  26.1 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.74 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  27 
 
 		 647 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.26 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.7 
 
 		 656 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  26.89 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  26.91 
 
 		 641 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.61 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.78 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.55 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.65 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  26.91 
 
 		 653 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  28.04 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.32 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.07 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.1 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.67 
 
 		 641 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.37 
 
 		 653 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  27.47 
 
 		 656 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.6 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  25.49 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  26.67 
 
 		 641 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  24.71 
 
 		 643 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.05 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  25.66 
 
 		 687 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.86 
 
 		 696 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  25.42 
 
 		 681 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  25.42 
 
 		 681 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  26.62 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.75 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.31 
 
 		 651 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.64 
 
 		 654 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  26.33 
 
 		 651 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  29.85 
 
 		 650 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.06 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.43 
 
 		 667 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.06 
 
 		 649 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.43 
 
 		 667 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.43 
 
 		 419 aa  123  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.41 
 
 		 427 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.38 
 
 		 652 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.21 
 
 		 641 aa  122  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.51 
 
 		 421 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  25.19 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  25.19 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.61 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  26.94 
 
 		 657 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.38 
 
 		 646 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.91 
 
 		 643 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  28.06 
 
 		 656 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  27.59 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.06 
 
 		 656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  24.07 
 
 		 653 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  28.46 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.12 
 
 		 658 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  27.83 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.63 
 
 		 653 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  26.41 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  26.67 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.97 
 
 		 653 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>