More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2567 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  84.71 
 
 		 249 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  81.45 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  85.59 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  85.59 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  83.68 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  84.72 
 
 		 253 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  81.78 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  83.68 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  83.68 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  85.15 
 
 		 249 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  83.18 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  82.27 
 
 		 250 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  77.82 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  81.36 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  77.93 
 
 		 249 aa  348  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  66.52 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  59.38 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  58.93 
 
 		 228 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  63.23 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  59.55 
 
 		 227 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  60.45 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  59.73 
 
 		 227 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  63.89 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  62.39 
 
 		 232 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  62.9 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  60.18 
 
 		 227 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  54.34 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  59.73 
 
 		 227 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  57.4 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  56.77 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  55.91 
 
 		 228 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  60.91 
 
 		 227 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  55.5 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  57.67 
 
 		 219 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  56.62 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.66 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.66 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.66 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.66 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  55.5 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  54.38 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.66 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.73 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  53.91 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  54.17 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.82 
 
 		 228 aa  241  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  54.13 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.82 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  57.27 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.82 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.82 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  56.82 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  53.21 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.36 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  53.51 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  52.78 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  52.97 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 		 233 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  52.7 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  55.07 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  55.67 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  54.87 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  51.58 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  51.1 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  55.76 
 
 		 224 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  55.45 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  54.91 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  54.46 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  54.91 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  54.46 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  51.61 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  51.33 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>