More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2559 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  87.67 
 
 		 227 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  86.34 
 
 		 227 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  84.07 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  83.19 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  82.3 
 
 		 228 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  82.3 
 
 		 228 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  83.7 
 
 		 227 aa  360  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  83.26 
 
 		 227 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  85.02 
 
 		 227 aa  358  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  82.88 
 
 		 226 aa  342  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  68.69 
 
 		 228 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  64.71 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  65.75 
 
 		 228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  60.44 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  68.2 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  60.09 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  60.91 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  61.19 
 
 		 249 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  61.19 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  61.47 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  60.18 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  60.18 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  64.09 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  60.18 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  60.18 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  60.18 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  59.73 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  63.93 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  59.64 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  63.64 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  60.44 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  61.47 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  60.65 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  59.64 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  61.09 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  61.88 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  58.72 
 
 		 246 aa  267  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  60.63 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  60.54 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  57.66 
 
 		 227 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  62.27 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  63.68 
 
 		 219 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  60.27 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  58.64 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  63.16 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  64.38 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  64.41 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  63.6 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  58.72 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  59.55 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  59.35 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  60 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  63.16 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  59.82 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  59.01 
 
 		 237 aa  257  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  61.01 
 
 		 233 aa  256  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  61.01 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  62.72 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.55 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  63.96 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  55.76 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  58.99 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  60.27 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  54.3 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.91 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  61.29 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  59.55 
 
 		 243 aa  247  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  60.56 
 
 		 228 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  60.56 
 
 		 228 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  60.56 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.91 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  62.12 
 
 		 200 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  59.55 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  55.05 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.01 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  59.11 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  59.56 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  59.11 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>