More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3413 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  85.39 
 
 		 242 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  82.27 
 
 		 236 aa  370  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  83.56 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  80.69 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  84.93 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  82.57 
 
 		 240 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  77.93 
 
 		 238 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  77.06 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  79.29 
 
 		 200 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  72.02 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  66.06 
 
 		 232 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  65.32 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  64.89 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  63.33 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  63.56 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  63.11 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 227 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  60.27 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  60.27 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  58.72 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  59.82 
 
 		 227 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  60.18 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  59.82 
 
 		 227 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  60 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  62.27 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  59.73 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  55.05 
 
 		 224 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  62.73 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  61.99 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  61.54 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  61.99 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  61.09 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  54.34 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1880  ABC transporter-related protein  71.35 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  61.54 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  53.15 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  53.15 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  53.15 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  60.81 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  53.15 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  62.44 
 
 		 224 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 226 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  61.97 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  53.46 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  52.7 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  52.7 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  55.3 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  52.7 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  52.7 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  52.97 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  52.23 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  58.8 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 		 226 aa  234  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  53.24 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  56.11 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  58.88 
 
 		 219 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  59.55 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  51.39 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  50.9 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  55.75 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  54.26 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  54.3 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  51.38 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  53.21 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  57.92 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  53.46 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  55.96 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  51.63 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0650  ABC transporter related  62.07 
 
 		 215 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.861483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.6 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  50.45 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  58.45 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  52.83 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  52.31 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  51.08 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  51.18 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  49.15 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.8 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  55.94 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>