More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1341 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  77.27 
 
 		 222 aa  354  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  76.82 
 
 		 222 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  75.11 
 
 		 228 aa  349  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  75.57 
 
 		 221 aa  347  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  72.85 
 
 		 221 aa  333  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  62.1 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  55 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  57.59 
 
 		 245 aa  255  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.08 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  50.88 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  51.13 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  51.35 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.73 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.13 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  51.13 
 
 		 241 aa  227  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  52.04 
 
 		 242 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.93 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.58 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.87 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.2 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  51.93 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50.45 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  49.33 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.98 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.43 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.75 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  51.12 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.45 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  53.36 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  49.14 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  51.13 
 
 		 657 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.56 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  53.71 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.04 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  52.7 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.04 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  51.58 
 
 		 656 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.49 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.42 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  51.3 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  49.1 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.49 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.98 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.32 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  50.22 
 
 		 657 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.17 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.77 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.17 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  46.61 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  52.47 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.75 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.96 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  50 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.88 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.73 
 
 		 231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  47.37 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.7 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>