More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0544 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  63.47 
 
 
221 aa  293  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  62.84 
 
 
222 aa  291  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  64.38 
 
 
221 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  62.39 
 
 
222 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  62.56 
 
 
228 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  62.1 
 
 
234 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  50 
 
 
232 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  51.85 
 
 
228 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 
228 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.39 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  51.38 
 
 
245 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
254 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.95 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.03 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  49.52 
 
 
246 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  49.06 
 
 
239 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  50.95 
 
 
228 aa  210  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.03 
 
 
225 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
228 aa  209  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.93 
 
 
228 aa  208  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  46.26 
 
 
228 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
230 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  48.36 
 
 
259 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.54 
 
 
242 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.33 
 
 
242 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  50.23 
 
 
241 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  46.45 
 
 
235 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.69 
 
 
252 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.4 
 
 
224 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.49 
 
 
229 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  48.36 
 
 
248 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  48.18 
 
 
264 aa  206  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
246 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
241 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.58 
 
 
226 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.95 
 
 
236 aa  205  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.49 
 
 
239 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
226 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 
226 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.58 
 
 
252 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  51.39 
 
 
247 aa  204  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  46.76 
 
 
220 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
236 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  45.83 
 
 
236 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.15 
 
 
657 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.36 
 
 
241 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.56 
 
 
248 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
240 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2062  ABC transporter related  50.67 
 
 
240 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  46.33 
 
 
655 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.47 
 
 
238 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 
240 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
226 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48.87 
 
 
253 aa  201  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
233 aa  201  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.86 
 
 
236 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.44 
 
 
642 aa  201  9e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.04 
 
 
260 aa  200  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  45.83 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  44.95 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.08 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.08 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.3 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.37 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.3 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.22 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  49.32 
 
 
254 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  46.76 
 
 
224 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
238 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.39 
 
 
225 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  49.32 
 
 
240 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.84 
 
 
229 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
224 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.13 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.22 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.21 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.22 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>