More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0917 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  57.59 
 
 
234 aa  255  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  56.56 
 
 
221 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  54.26 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  55.86 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
222 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  49.12 
 
 
232 aa  241  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
221 aa  238  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.37 
 
 
252 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.27 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.08 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.37 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.08 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.64 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.27 
 
 
233 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.98 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.4 
 
 
266 aa  217  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.75 
 
 
253 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  47.53 
 
 
657 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.93 
 
 
237 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 
243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  47.32 
 
 
241 aa  214  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.09 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.04 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  46.98 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  44.93 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  46.73 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
226 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.91 
 
 
239 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  51.38 
 
 
219 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  49.77 
 
 
254 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 
253 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.09 
 
 
253 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  50.69 
 
 
236 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
658 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
230 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.29 
 
 
225 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.39 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 
228 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 
238 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.54 
 
 
235 aa  208  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  46.36 
 
 
235 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 
211 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.13 
 
 
225 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
226 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  45.37 
 
 
657 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.78 
 
 
228 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.54 
 
 
242 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
228 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.79 
 
 
230 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  46.76 
 
 
657 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  46.3 
 
 
656 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.33 
 
 
252 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.6 
 
 
248 aa  205  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
218 aa  205  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  44.34 
 
 
222 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.51 
 
 
241 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
226 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  205  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.29 
 
 
236 aa  204  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  48.34 
 
 
236 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
241 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  45.45 
 
 
235 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
237 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.73 
 
 
234 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
228 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  47.3 
 
 
227 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  47.03 
 
 
237 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.73 
 
 
238 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
238 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
238 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
237 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  45.07 
 
 
248 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  45.37 
 
 
228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 
241 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.22 
 
 
277 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  43.42 
 
 
244 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.84 
 
 
230 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  46.61 
 
 
248 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  42.49 
 
 
260 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
220 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  46.22 
 
 
234 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 
228 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  44.8 
 
 
248 aa  202  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
236 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.26 
 
 
642 aa  202  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
240 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.78 
 
 
226 aa  201  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.72 
 
 
225 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  45.25 
 
 
264 aa  201  8e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>