More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0445 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  70 
 
 
220 aa  325  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  65.78 
 
 
229 aa  321  5e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  66.36 
 
 
224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
217 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
216 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 
216 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.62 
 
 
230 aa  264  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  55.24 
 
 
238 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  59.33 
 
 
218 aa  263  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  55.24 
 
 
238 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  57 
 
 
408 aa  258  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 
237 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  54.03 
 
 
243 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  53.33 
 
 
237 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
237 aa  254  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  53.55 
 
 
281 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.61 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  44 
 
 
224 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  46.23 
 
 
222 aa  201  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
246 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.12 
 
 
228 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  44.04 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  43.89 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  43.22 
 
 
266 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  42.2 
 
 
252 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.58 
 
 
648 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.55 
 
 
237 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.6 
 
 
240 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.28 
 
 
239 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  45.23 
 
 
271 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  44.55 
 
 
247 aa  191  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
241 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
254 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 
227 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  45.81 
 
 
223 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.04 
 
 
230 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 
228 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 
238 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.24 
 
 
239 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.94 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.01 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  44.81 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.89 
 
 
647 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  44.29 
 
 
228 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  45.59 
 
 
232 aa  189  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
228 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
228 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
222 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.78 
 
 
232 aa  188  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.8 
 
 
227 aa  187  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  38.99 
 
 
252 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  46.88 
 
 
224 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  42.73 
 
 
236 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  44.29 
 
 
228 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.82 
 
 
228 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 
221 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.23 
 
 
649 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  42.11 
 
 
242 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.56 
 
 
653 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  40.18 
 
 
229 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 
224 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  41.52 
 
 
655 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  46.27 
 
 
230 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
223 aa  185  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
232 aa  185  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.09 
 
 
228 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  44.95 
 
 
251 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  40 
 
 
288 aa  184  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
248 aa  184  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
658 aa  184  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  41.1 
 
 
254 aa  184  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  46.23 
 
 
654 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  42.65 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.07 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  40.09 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  43.84 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  47.24 
 
 
655 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  42.4 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.78 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  43.98 
 
 
248 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.28 
 
 
227 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.28 
 
 
246 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
235 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.53 
 
 
649 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  40.83 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  38.4 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  44.29 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  44.28 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>