More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2759 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  66.11 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  63.6 
 
 		 252 aa  299  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  63.56 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  59.36 
 
 		 269 aa  293  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  63.37 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.18 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.21 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  58.47 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  55.87 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  59.21 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.34 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  59.13 
 
 		 455 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  58.77 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  59.24 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  64.2 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  64.29 
 
 		 277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  59.03 
 
 		 266 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  56.43 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  56.61 
 
 		 445 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  54.36 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  59.13 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  64.47 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  57.38 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  60 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.39 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.83 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  53.81 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  51.79 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.42 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  54.92 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  60.71 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  53.31 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.76 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  52.81 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.15 
 
 		 272 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.98 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.17 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.01 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  62.27 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 279 aa  235  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.66 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.66 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  50.65 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.16 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.78 
 
 		 237 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  49.57 
 
 		 653 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.5 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.84 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.7 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.33 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.12 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.7 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  49.55 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.67 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.75 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  46.61 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.34 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47.03 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  52.49 
 
 		 563 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  48.5 
 
 		 565 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>